在水果洗涤和筛选过程中对洗涤用水进行消毒将大大减少水果的腐烂损失。
过去惯用的消毒剂为用亚氯酸盐，但其强烈的刺激气味和非常高的消耗量限制了使用范围，并且当pH值高于7.5时其微生物消毒效果急剧下降，而二氧化氯在pH为6－9的宽范围内均有强的消毒效果。

使用二氧化氯作消毒剂将使水果的腐烂率大大降低。同时，消毒作用过程不产生难闻的刺激气味。
二氧化氯的消毒杀菌效果不受pH值的影响。
由于二氧化氯的消耗量极小，所以不会带来污染问题。